תוכנית הוראת לימודי האסלאם באקדמיית אלקאסמי מיועדת למורות ולמורים ללימודי אסלאם בבתי הספר היסודיים והעל־יסודיים, המבקשים להעמיק את הידע הדיסציפלינרי, הפדגוגי והמחקרי שלהם, ולפתח דרכי הוראה חדשניות, רלוונטיות ומשמעותיות לתלמידות ולתלמידים בחברה הערבית.

התוכנית נבנתה מתוך הכרה בצורך לחדש את הוראת לימודי האסלאם בבתי הספר: לעבור מהוראה המבוססת בעיקר על שינון והצגה פרונטלית אל הוראה המעודדת הבנה, חשיבה ביקורתית, דיון, חקר, רלוונטיות לחיי היומיום וחיבור בין מקורות הדת לבין שאלות חברתיות, מוסריות ותרבותיות עכשוויות.

ייחודה של התוכנית הוא בשילוב בין לימודי אסלאם כתחום דעת, פדגוגיה חדשנית, פיתוח תוכניות לימודים, חשיבה ביקורתית והשוואתית, התנסות מעשית, ועיסוק בסוגיות עכשוויות כגון מסורת ומודרנה, מיעוט מוסלמי במדינה לא מוסלמית, מגדר, זרמים באסלאם, דיאלוג בין־דתי, משפט מוסלמי ויחסי דת, חברה ותרבות.

1. המסלול הרגיל (ללא תזה) - פדגוגיה חדשנית ועומק דתי־תרבותי
   מסלול יישומי המיועד למורות ולמורים המבקשים להעמיק את הכשרתם הפדגוגית והדיסציפלינרית ולהוביל לשינוי בקרב הלומדים. המסלול משלב פיתוח תוכניות לימודים ויחידות הוראה המאפשרות למידה מתוך דיון וחשיבה עצמאית.
   • היקף הלימודים: 18 שעות שבועיות (ש"ש) / 36 נקודות זכות (נ"ז) הנפרסות על פני שנתיים.
   • רכיב מסכם: סמנריון מורחב עם ליווי צמוד.
   • תחומי לימוד מרכזיים: פיתוח תוכניות לימודים, זרמים באסלאם, מיעוט מוסלמי, משפט מוסלמי, דילמות ביישום "החיקוי והחידוש", השוואה בין דתית, קוראן ומודרניות, ומגדר באסלאם.
2. המסלול המחקרי (עם תזה) - העמקה מחקרית והתחדשות
   מסלול המיועד לסטודנטיות ולסטודנטים מצטיינים המעוניינים לפתח יכולת מחקר עצמאית בתחום, לכתוב עבודת תזה ולהמשיך בעתיד ללימודים מתקדמים או למחקר. בנוסף לליבת התוכן, המסלול כולל דגש נרחב על מתודולוגיה מחקרית.
   • היקף הלימודים: 20 שעות שבועיות (ש"ש) / 40 נקודות זכות (נ"ז) הנפרסות על פני שנתיים.
   • רכיב מסכם: עבודת תזה מחקרית אקדמית.
   • תחומי לימוד מרכזיים: שיטות מחקר כמותיות ואיכותניות מתקדמות, סדנת תזה מקיפה, חקר סוגיות דתיות ופדגוגיות לצד קורסי הליבה בתחום הדעת.

• תואר ראשון בהתמחות לימודי האסלאם / דת האסלאם בממוצע 80 לפחות.
• תעודת הוראה או תעודת עובד חינוך.
• מעבר ריאיון קבלה אישי או קבוצתי.
• לבוגרי מוסדות מחו"ל: אישור שקילות לתואר ותרגום מאושר של גיליון הציונים.

• קבלה ישירה: ממוצע 90 ומעלה בלימודי התואר הראשון.
• מעבר במהלך הלימודים: ממוצע 90 ומעלה בשנת הלימודים הראשונה בתואר השני (כולל ממוצע 90+ בקורסי המחקר הכמותי והאיכותני).
• סמינריון מחקרי: ציון 90 לפחות בסמינריון בשנה א'.
• נדרש אישור ועדת התוכנית ומציאת מנחה מתאים לעבודת התזה.

במסלול הרגיל יוענק תואר M.Ed. במסלול המחקרי יוענק תואר M.Ed. (מסלול מחקרי עם תזה) לאחר השלמת עבודת התזה ואישורה.

בוגרי התוכנית יכולים להשתלב בהוראת לימודי אסלאם בבתי ספר יסודיים ועל־יסודיים, בריכוז מקצוע דת האסלאם, בפיתוח יחידות הוראה ותוכניות לימודים, בהדרכת מורים וצוותים חינוכיים, בהובלת חדשנות פדגוגית, וכן בהמשך לימודים לתואר שלישי (דוקטורט) באוניברסיטאות (בדגש על בוגרי המסלול המחקרי).